Группа была образована в 1987 году в --- школьными приятелями Билли Джо Армстронгом, Майклом Райаном Притчардом и называлась «Sweet children». Тогда же Билли Джо написал свою первую песню «Why Do You Want Him?». В 1989 году к группе присоединяется барабанщик Эл Собрант (реальное имя — Джон Алан Киффмайер), с приходом которого группа сменила название на Green Day. Первое официальное выступление Green Day прошло в «Rod’s Hickory Pit in Vallejo» (штат Калифорния), после чего группа начала выступать в клубах на Gilman Street in Berkeley. В этом же году (1989) группа записала свой первый EP «1,000 Hours». После чего Билли Джо, в отличие от Майка, бросил школу. В 1990 был записан второй ЕР «Slappy hours».Оба ЕР были записаны в студии Lookout!Records, принадлежащей другу группы Ларри Ливермо. Он же привел в группу Тре Кула (реальное имя-Frank Edwin Wright III), который занял место Эла Собранта, ушедшего из коллектива ради учебы в колледже.
В 1992 году на студии Art of Ears (Сан-Франциско) Green Day записали второй альбом «Kerplunk!». После выпуска «Kerplunk!» группе удалось привлечь к себе внимание многих крупных лейблов, с одним из которых позднее будет был заключен договор.
В апреле 1993 года Green Day подписывает контракт с Reprise Records. И уже весной 1994 года был выпущен третий альбом «Dookie». Благодаря поддержке MTV песня «Longview» становится хитом. Позже будут выпущены песни Basket case, визитная карточка группы и When I come around. В этом же году Green Day взяли «Грэмми» за «Best Alternative Music Performance». В начале 1995 года «Dookie» был продан в 5 млн копий в США и 12 млн во всём мире. Тут же молодые люди сталкиваются с негативным отношением к себе и своему творчеству со стороны бывших друзей и товарищей — поступок Green Day полностью противоречил идеологии панка. Отныне вход в 924 Gilman Street был им закрыт.
В 1995 году был выпущен четвёртый альбом «Insomniac». «Insomniac» отличался от «Dookie» резким и агрессивным, «потяжелевшим» звучанием. Green Day не хотели становится одной из групп, чью индивидуальность поглотил шоу-бизнес. Поклонниками альбом был встречен неоднозначно. Кто-то отвернулся от группы, кто-то проникся к музыкантам большим уважением. Так или иначе, тираж диска составил 2 000 000 копий, что было явным провалом.
После тура в поддержку «Insomniac» группа приступила к работе над следующим альбомом «Nimrod», который вышел в 1997 году. Этот альбом говорит о профессиональном взрослении коллектива — группа не ограничивает себя привычными рамками панк-звучания, в альбоме звучат и композиции в привычном стиле Green Day (Nice guys finish last), и некое наследие «Insomniac» (Hitchin' a ride). Но главным (и неожиданным) хитом становится акустическая баллада Good riddance (Time of you’re Life). Позже участники группы скажут: «То, что мы поместили эту песню в альбом, пожалуй, самое лучшее, что мы сделали в жизни». Несмотря на небольшой тираж, «Nimrod» среди поклонников и музыкальных критиков стал считаться лучшей работой группы.
После серии концертов группа надолго пропала с экранов телевизоров и волн радиостанций. Начали появляться слухи о распаде Green Day, но официальных заявлений не поступало.
В 2000 году состоялся концерт в Neil Young’s Bridge School Benefit, который стал первым живым концертом в акустическом виде. Позже группа вместе с продюсером Робом Ковалло, работавшим с ними с самого начала, начинает запись нового альбома «Warning», который вышел в конце 2000 года. Альбом, выполненный в жанре пауэр-поп, стал считаться для коллектива прощальным: резкая смена музыкального стиля в сторону поп-музыки, личные разногласия в группе негативно сказались на работе. Даже присутствие зрелых и многозначных текстов не особо спасало пластинку — из нее пропала беззаботность и атмосфера, присущие группе.
В конце 2001 года Green Day выпускают сборник «International Superhits!», куда вошли все синглы и несколько новых треков. Затем, в 2002 году, выходит компиляция «Shenanigans», содержащая более ранние, не издававшиеся песни. После этих двух релизов слухи о распаде группы стали появляться с пугающей регулярностью — как правило, выпуск лучших хитов говорит о творческом застое группы и предвещает конец ее деятельности. 21 сентября 2004 года вышел новый альбом Green Day «American idiot», который привлек к себе большое внимание. «American idiot» был направлен против политики Дж. Буша мл. и того пути, по которому он ведёт Америку. Это был дебют для Green Day в том плане, что альбом тут же захватил лидирующие позиции в авторитетном Billboard Charts, также, как и по всему миру. Наибольшую популярность взяли песни «American Idiot» и «Boulevard Of Broken Dreams». Альбом был номинирован на 7 «Гремми». Но удостоился только одной за «Лучший рок альбом». Кроме того Green Day собрали такие награды, как MTV Music Awards, Peoples Choice Award и многие другие. Green Day в очередной раз доказали, что по-прежнему являются одной из лучших рок-групп в мире.
После релиза Green Day почти два года провели гастролируя по миру. Летом 2005 состоялся самый масштабный на сегодняшний день их концерт на стадионе Milton Keynes в Лондоне. За два концертных дня Green Day сыграли перед 130-тысячной аудиторией.
В 2006 году Green Day выступили дуэтом с U2. Их песня «The Saints Are Coming» сразу же заняла первые места чартов.
В мае 2009 году Green Day выпускают новый альбом «21st Century Breakdown». Альбом сразу был признан многими фанатами Green Day как их лучшее творение и возглавил национальные чарты более 20 стран, а многие песни этого альбома (какие как «Know Your Enemy», «21 Guns») стали супер хитами. Проданный тираж альбома по состоянию на 10 июля составил 1.7 млн копий.